DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Helicobacter pylori'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1E9Y_B_HAEB800 1e9y HAE

DB00551
(Acetohydroxamic
Acid) 		Helicobacter
pylori 		UREASE SUBUNIT BETA PF00449
(Urease_alpha)
PF01979
(Amidohydro_1) 		5 HIS B 136
HIS B 221
HIS B 248
HIS B 274
ASP B 362
 HAE B 800
2XRH_A_NIOA200 2xrh NIO

DB00627
(Niacin) 		Helicobacter
pylori 		PROTEIN HP0721 PF06518
(DUF1104) 		7 GLY A  36
ILE A  43
THR A  47
ARG A  88
GLN A  89
MET A 104
LEU A 110
 NIO A 200
3UB9_A_NHYA301 3ub9 NHY

DB01005
(Hydroxyurea) 		Helicobacter
pylori 		CHEMORECEPTOR TLPB PF17200
(sCache_2) 		10 VAL A 103
ASP A 114
VAL A 116
ASN A 117
TYR A 136
TYR A 140
TYR A 153
MET A 155
LYS A 166
TYR A 185
 NHY A 301
3UB9_B_NHYB301 3ub9 NHY

DB01005
(Hydroxyurea) 		Helicobacter
pylori 		CHEMORECEPTOR TLPB no annotation 10 VAL B 103
ASP B 114
VAL B 116
ASN B 117
TYR B 136
TYR B 140
TYR B 153
MET B 155
LYS B 166
TYR B 185
 NHY B 301
4YGF_A_AZMA303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		PF00194
(Carb_anhydrase) 		11 LYS A  88
ASN A 108
HIS A 110
HIS A 112
HIS A 129
VAL A 131
VAL A 141
LEU A 190
THR A 191
ALA A 192
TRP A 201
 AZM A 303
4YGF_B_AZMB303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 11 ASN B 108
HIS B 110
HIS B 112
GLU B 116
HIS B 129
VAL B 131
LYS B 133
VAL B 141
LEU B 190
THR B 191
TRP B 201
 AZM B 303
4YGF_C_AZMC303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 11 LYS C  88
ASN C 108
HIS C 110
HIS C 112
HIS C 129
VAL C 131
VAL C 141
LEU C 190
THR C 191
ALA C 192
TRP C 201
 AZM C 303
4YGF_D_AZMD303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 11 ASN D 108
HIS D 110
HIS D 112
GLU D 116
HIS D 129
VAL D 131
VAL D 141
LEU D 190
THR D 191
ALA D 192
TRP D 201
 AZM D 303
4YGF_E_AZME303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 12 LYS E  88
ASN E 108
HIS E 110
HIS E 112
GLU E 116
HIS E 129
VAL E 131
LYS E 133
VAL E 141
LEU E 190
THR E 191
TRP E 201
 AZM E 303
4YGF_F_AZMF303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 9 ASN F 108
HIS F 110
HIS F 112
HIS F 129
VAL F 131
VAL F 141
LEU F 190
THR F 191
TRP F 201
 AZM F 303
4YGF_G_AZMG303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 12 LYS G  88
ASN G 108
HIS G 110
HIS G 112
HIS G 129
VAL G 131
LYS G 133
VAL G 141
LEU G 190
THR G 191
ALA G 192
TRP G 201
 AZM G 303
4YGF_H_AZMH303 4ygf AZM

DB00819
(Acetazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 9 ASN H 108
HIS H 110
HIS H 112
HIS H 129
VAL H 131
VAL H 141
LEU H 190
THR H 191
TRP H 201
 AZM H 303
4YHA_A_MZMA303 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		PF00194
(Carb_anhydrase) 		12 LYS A  88
ASP A 107
ASN A 108
HIS A 110
HIS A 112
HIS A 129
VAL A 131
VAL A 141
LEU A 190
THR A 191
ALA A 192
TRP A 201
 MZM A 303
4YHA_B_MZMB303 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 10 ASP B 107
ASN B 108
HIS B 110
HIS B 112
HIS B 129
VAL B 131
VAL B 141
LEU B 190
THR B 191
ALA B 192
 MZM B 303
4YHA_C_MZMC303 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 11 LYS C  88
ASP C 107
ASN C 108
HIS C 110
HIS C 112
HIS C 129
VAL C 131
VAL C 141
LEU C 190
THR C 191
TRP C 201
 MZM C 303
4YHA_D_MZMD302 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 11 LYS D  88
ASN D 108
HIS D 110
HIS D 112
GLU D 116
HIS D 129
VAL D 131
LEU D 190
THR D 191
ALA D 192
TRP D 201
 MZM D 302
4YHA_E_MZME303 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 13 LYS E  88
ASN E 108
HIS E 110
HIS E 112
GLU E 116
HIS E 129
VAL E 131
VAL E 141
LEU E 190
THR E 191
ALA E 192
PRO E 194
TRP E 201
 MZM E 303
4YHA_F_MZMF302 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 10 ASP F 107
ASN F 108
HIS F 110
HIS F 112
HIS F 129
VAL F 131
LEU F 190
THR F 191
ALA F 192
TRP F 201
 MZM F 302
4YHA_G_MZMG303 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 12 LYS G  88
ASN G 108
HIS G 110
HIS G 112
HIS G 129
VAL G 131
LYS G 133
VAL G 141
LEU G 190
THR G 191
ALA G 192
TRP G 201
 MZM G 303
4YHA_H_MZMH303 4yha MZM

DB00703
(Methazolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 10 ASN H 108
HIS H 110
HIS H 112
GLU H 116
HIS H 129
VAL H 131
LEU H 190
THR H 191
ALA H 192
TRP H 201
 MZM H 303
5FXT_A_0LAA1376 5fxt 0LA

DB00821
(Carprofen) 		Helicobacter
pylori 		DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		7 LYS A 152
LEU A 155
THR A 174
PRO A 244
ILE A 249
LEU A 369
MET A 371
 0LA A1376
5G48_A_1FLA1375 5g48 1FL

DB00861
(Diflunisal) 		Helicobacter
pylori 		DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		PF00712
(DNA_pol3_beta)
PF02767
(DNA_pol3_beta_2)
PF02768
(DNA_pol3_beta_3) 		8 THR A 173
THR A 175
LEU A 178
PRO A 243
ILE A 248
PRO A 347
LEU A 368
MET A 370
 1FL A1375
5G48_B_1FLB1375 5g48 1FL

DB00861
(Diflunisal) 		Helicobacter
pylori 		DNA POLYMERASE III
SUBUNIT BETA 		no annotation 9 LEU B 154
THR B 173
THR B 175
LEU B 178
PRO B 243
ILE B 248
PRO B 347
LEU B 368
MET B 370
 1FL B1375
5HFJ_A_SAMA301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		PF01555
(N6_N4_Mtase) 		14 ASP A   8
ALA A   9
ASP A  29
PRO A  31
LYS A 165
LYS A 167
PHE A 195
GLY A 197
SER A 198
THR A 200
GLU A 216
SER A 217
GLU A 218
TYR A 221
 SAM A 301
5HFJ_B_SAMB301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 14 ASP B   8
ALA B   9
ASP B  29
PRO B  31
HIS B 168
THR B 170
GLN B 171
PHE B 195
GLY B 197
SER B 198
THR B 200
GLU B 216
SER B 217
TYR B 221
 SAM B 301
5HFJ_C_SAMC301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 16 ASP C   8
ALA C   9
ASP C  29
PRO C  31
HIS C 168
THR C 170
GLN C 171
LYS C 172
PHE C 195
GLY C 197
SER C 198
THR C 200
GLU C 216
SER C 217
GLU C 218
TYR C 221
 SAM C 301
5HFJ_D_SAMD301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 12 ASP D   8
ALA D   9
ASP D  29
PRO D  31
PHE D 195
GLY D 197
SER D 198
THR D 200
GLU D 216
SER D 217
GLU D 218
TYR D 221
 SAM D 301
5HFJ_E_SAME301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 12 ASP E   8
ALA E   9
ASP E  29
PRO E 169
LYS E 172
PHE E 195
GLY E 197
SER E 198
THR E 200
GLU E 216
SER E 217
TYR E 221
 SAM E 301
5HFJ_F_SAMF301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 12 ASP F   8
ALA F   9
ASP F  29
PRO F  31
THR F 170
GLN F 171
PHE F 195
GLY F 197
SER F 198
GLU F 216
SER F 217
TYR F 221
 SAM F 301
5HFJ_G_SAMG301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 16 ASP G   8
ALA G   9
ASP G  29
PRO G  31
HIS G 168
THR G 170
GLN G 171
LYS G 172
PHE G 195
GLY G 197
SER G 198
THR G 200
GLU G 216
SER G 217
GLU G 218
TYR G 221
 SAM G 301
5HFJ_H_SAMH301 5hfj SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Helicobacter
pylori 		ADENINE SPECIFIC DNA
METHYLTRANSFERASE
(DPNA) 		None 14 ASP H   8
ALA H   9
ASP H  29
PRO H  31
THR H 170
GLN H 171
LYS H 172
PHE H 195
GLY H 197
SER H 198
THR H 200
GLU H 216
SER H 217
TYR H 221
 SAM H 301
5TT3_A_EZLA303 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		PF00194
(Carb_anhydrase) 		10 HIS A 110
HIS A 112
HIS A 129
VAL A 131
VAL A 141
LEU A 190
THR A 191
ALA A 192
PRO A 194
TRP A 201
 EZL A 303
5TT3_B_EZLB303 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 9 HIS B 110
HIS B 112
HIS B 129
VAL B 131
VAL B 141
LEU B 190
THR B 191
ALA B 192
TRP B 201
 EZL B 303
5TT3_C_EZLC303 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 10 HIS C 110
HIS C 112
HIS C 129
VAL C 131
VAL C 141
LEU C 190
THR C 191
ALA C 192
PRO C 194
TRP C 201
 EZL C 303
5TT3_E_EZLE303 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 9 HIS E 110
HIS E 112
HIS E 129
VAL E 131
VAL E 141
LEU E 190
THR E 191
ALA E 192
TRP E 201
 EZL E 303
5TT3_F_EZLF302 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 8 HIS F 110
HIS F 112
HIS F 129
VAL F 131
VAL F 141
LEU F 190
THR F 191
TRP F 201
 EZL F 302
5TT3_G_EZLG303 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 9 HIS G 110
HIS G 112
HIS G 129
VAL G 131
VAL G 141
LEU G 190
THR G 191
ALA G 192
TRP G 201
 EZL G 303
5TT3_H_EZLH303 5tt3 EZL

DB00311
(Ethoxzolamide) 		Helicobacter
pylori 		ALPHA-CARBONIC
ANHYDRASE 		no annotation 8 HIS H 110
HIS H 112
HIS H 129
VAL H 131
LEU H 190
THR H 191
ALA H 192
TRP H 201
 EZL H 303